聖公會中學為馬尼拉眾多學校中，首批獲得教育部批准實施新式混成教育模式的學校。在混成制度下，學生將能根據政府規定於校園內上部分的課程。
經歷兩年的時間，今日聖公會首次以混成先導計劃的方式邀請學生返回校園。混成制度將全面於2022-2023學年八月開始執行，本校謹慎防範病毒傳播，包括進入校園前測量體溫、勤洗手和環境整潔、加強通風等等。這些措施獲得近期教育部委派的官員，參訪本校後所認同。
在2022-2023學年，聖公會的家長可以選擇混成授課或全面線上授課。本校也將繼續提供小班授課，如此，教師能夠將注意力放在每位學生身上。我們將致力於實體或線上的每一堂課，比起混成彈性學習制度，本校堅信混成授課更好，因為教師不必將注意力分散於實體與線上課程。同時，適用於實體課程的教學方法，與線上課程依然有些微差異。
聖公會中學將持續培育學生在社會上的身心靈全人教育。本校預計開放有興趣參與課外和聯課活動的學生，需根據教育部的規定參與活動。
